MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
2	NC_014554	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	308179192
3	NC_014554	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
4	NC_014554	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179192
5	NC_014554	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	308179192
6	NC_014554	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
7	NC_014554	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179192
8	NC_014554	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	308179192
9	NC_014554	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	308179192
10	NC_014554	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	308179192
11	NC_014554	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179192
12	NC_014554	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
13	NC_014554	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179192
14	NC_014554	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179192
15	NC_014554	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	308179192
16	NC_014554	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179192
17	NC_014554	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179192
18	NC_014554	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179192
19	NC_014554	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	308179192
20	NC_014554	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179192
21	NC_014554	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179192
22	NC_014554	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	308179192
23	NC_014554	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	308179192
24	NC_014554	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179192
25	NC_014554	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014554	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014554	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014554	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014554	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014554	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179193
31	NC_014554	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179193
32	NC_014554	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179193
33	NC_014554	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
34	NC_014554	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
35	NC_014554	A	7	7	1800	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	308179193
36	NC_014554	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
37	NC_014554	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
38	NC_014554	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
39	NC_014554	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179193
40	NC_014554	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
41	NC_014554	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179193
42	NC_014554	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179193
43	NC_014554	ACGATT	2	12	2440	2451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308179193
44	NC_014554	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179193
45	NC_014554	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
46	NC_014554	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	308179193
47	NC_014554	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179193
48	NC_014554	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014554	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014554	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014554	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014554	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014554	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014554	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014554	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014554	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014554	A	6	6	2982	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014554	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014554	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014554	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014554	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014554	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014554	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	308179194
64	NC_014554	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179194
65	NC_014554	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179194
66	NC_014554	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179194
67	NC_014554	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	308179194
68	NC_014554	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179194
69	NC_014554	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179194
70	NC_014554	TTGAAG	2	12	3385	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179194
71	NC_014554	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	308179194
72	NC_014554	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	308179195
73	NC_014554	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
74	NC_014554	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179195
75	NC_014554	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179195
76	NC_014554	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	308179195
77	NC_014554	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
78	NC_014554	TATGGA	2	12	3845	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
79	NC_014554	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
80	NC_014554	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
81	NC_014554	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179195
82	NC_014554	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
83	NC_014554	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	308179195
84	NC_014554	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179195
85	NC_014554	GAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179195
86	NC_014554	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
87	NC_014554	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
88	NC_014554	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179195
89	NC_014554	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179195
90	NC_014554	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179195
91	NC_014554	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	308179195
92	NC_014554	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179195
93	NC_014554	CGAAAA	2	12	4570	4581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	308179196
94	NC_014554	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
95	NC_014554	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
96	NC_014554	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
97	NC_014554	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
98	NC_014554	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
99	NC_014554	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179196
100	NC_014554	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	308179196
101	NC_014554	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
102	NC_014554	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
103	NC_014554	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
104	NC_014554	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
105	NC_014554	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
106	NC_014554	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179196
107	NC_014554	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
108	NC_014554	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
109	NC_014554	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
110	NC_014554	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
111	NC_014554	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
112	NC_014554	ATAAGA	2	12	5295	5306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308179196
113	NC_014554	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	308179196
114	NC_014554	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
115	NC_014554	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
116	NC_014554	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179196
117	NC_014554	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	308179196
118	NC_014554	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
119	NC_014554	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179196
120	NC_014554	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
121	NC_014554	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
122	NC_014554	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179196
123	NC_014554	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179196
124	NC_014554	A	6	6	5785	5790	100 %	0 %	0 %	0 %	308179196
125	NC_014554	TAG	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
126	NC_014554	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
127	NC_014554	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
128	NC_014554	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179196
129	NC_014554	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	308179196
130	NC_014554	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
131	NC_014554	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179196
132	NC_014554	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179196
133	NC_014554	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	308179196
134	NC_014554	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179196
135	NC_014554	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179196
136	NC_014554	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179196
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391	NC_014554	A	7	7	19156	19162	100 %	0 %	0 %	0 %	308179207
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396	NC_014554	TAA	2	6	19290	19295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179207
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399	NC_014554	TAA	2	6	19410	19415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179207
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401	NC_014554	AAG	2	6	19588	19593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179207
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